Адокса мускусная — многолетние травянистое растение высотой от 5 до 10—15 см.
Корневище короткое, беловатое[2].
Для адоксы характерны подземные столоны — однолетние удлинённые тонкие подземные побеги с недоразвитыми листьями.
Стебель обычно один, иногда их несколько[6].
Листья имеются как прикорневые (один или два дваждытройчатых на черешках длиной до 5 см шириной также до 5 см), так и стеблевые (два тройчатых супротивных)[6]. Соцветие адоксы мускусной (Adoxa moschatellina)
Цветки мелкие, зеленоватые, со слабым мускусным запахом, собраны в верхушечных головках. Цветков в соцветиях обычно пять. Центральный цветок — актиноморфный, четырёхдольный, с двумя долями чашечки, с четырьми тычинками. Боковые цветки — слабо зигоморфные, пятидольные, с тремя долями чашечки, с пятью тычинками. Каждая тычинка расщеплена надвое до основания[6].
Цветение обычно начинается ранней весной, нередко ещё до распускания листьев на деревьях. Длительность цветения — небольшая. Опыление происходит с помощью насекомых; может происходить и самоопыление. Примерное время цветения в Европейской части России — апрель-июнь.
Плоды — синкарпные костянки зеленоватого цвета. Распространяются рыбами (это возможно, поскольку растения нередко растут рядом с водоёмами; к моменту созревания плодов стебель слабеет, изгибается и плоды оказываются у самой поверхности воды) или птицами.